MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli 042 plasmid pAA

Total Repeats: 592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017627	CCT	2	6	877	882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017627	AAT	2	6	886	891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017627	A	7	7	939	945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017627	A	7	7	960	966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017627	TCA	2	6	972	977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017627	CGG	2	6	1031	1036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017627	GCA	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017627	TCGC	2	8	1154	1161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017627	GCA	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017627	TAA	2	6	1286	1291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017627	TAT	2	6	1296	1301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017627	T	8	8	1301	1308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017627	T	6	6	1328	1333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017627	TAA	2	6	1391	1396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017627	ATG	2	6	2972	2977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017627	ACCAT	2	10	3159	3168	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017627	TCAA	2	8	3197	3204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017627	CCT	2	6	3551	3556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017627	A	6	6	3593	3598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017627	ATT	2	6	3604	3609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017627	CAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017627	CTC	2	6	3681	3686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017627	GCA	2	6	3717	3722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017627	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017627	GCG	2	6	3889	3894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017627	CAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017627	CTGA	2	8	4248	4255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017627	AT	3	6	4355	4360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017627	CA	3	6	4377	4382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017627	ATT	2	6	4390	4395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017627	TA	3	6	4412	4417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017627	TTA	2	6	4426	4431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017627	TA	3	6	4446	4451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017627	ACT	2	6	6888	6893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017627	TAT	2	6	9487	9492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017627	CT	3	6	9612	9617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017627	AG	3	6	9622	9627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017627	TTA	2	6	9682	9687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017627	TAAAA	2	10	9693	9702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017627	TGA	2	6	9706	9711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017627	TAAG	2	8	9715	9722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017627	ACA	2	6	9888	9893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017627	CCG	2	6	9894	9899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017627	TGT	3	9	9981	9989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017627	GCT	2	6	10164	10169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017627	CTT	2	6	10230	10235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017627	CGG	2	6	10280	10285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017627	CAG	2	6	10295	10300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017627	CCA	2	6	10316	10321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017627	GCA	2	6	10362	10367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017627	AAGC	2	8	10376	10383	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017627	GGAT	2	8	10397	10404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017627	TCA	2	6	10469	10474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017627	GTCTTC	2	12	10499	10510	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017627	TTA	2	6	10511	10516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017627	GCA	2	6	10521	10526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017627	ATC	2	6	10543	10548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017627	GTCA	2	8	10564	10571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017627	CAG	2	6	10606	10611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017627	GCA	2	6	10615	10620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017627	CAG	2	6	10639	10644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017627	GCCG	2	8	10668	10675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017627	CAG	2	6	10738	10743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017627	AGGTGC	2	12	10780	10791	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017627	CGG	2	6	10881	10886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017627	CCG	2	6	10913	10918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017627	GCA	2	6	10927	10932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017627	CT	3	6	11057	11062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017627	CGG	2	6	11102	11107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017627	CGG	2	6	11141	11146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017627	CAG	2	6	11251	11256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017627	GTC	2	6	11263	11268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017627	AGA	2	6	11269	11274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017627	GAG	2	6	12128	12133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017627	ACTG	2	8	12289	12296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017627	CAG	2	6	12559	12564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017627	CAT	2	6	12594	12599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017627	TCT	2	6	12600	12605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017627	AC	3	6	13960	13965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017627	GCAT	2	8	14006	14013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017627	TAT	2	6	14040	14045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017627	AAT	2	6	14087	14092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017627	AAGCG	2	10	14198	14207	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017627	TGA	2	6	14222	14227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017627	GAA	2	6	14245	14250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017627	ACA	2	6	14253	14258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017627	CAG	2	6	14272	14277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017627	CAT	2	6	14290	14295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017627	ATA	2	6	14381	14386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017627	TAA	2	6	14437	14442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017627	GGAT	2	8	14464	14471	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017627	GAA	2	6	14472	14477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017627	AAC	2	6	14500	14505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017627	AAC	2	6	14521	14526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017627	TCT	2	6	14602	14607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017627	TTC	2	6	14633	14638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017627	AATG	2	8	14639	14646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017627	CACTG	2	10	15321	15330	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017627	T	7	7	15338	15344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017627	ATA	2	6	15447	15452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017627	TAT	3	9	15453	15461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017627	TAG	2	6	15485	15490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017627	TA	3	6	15491	15496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017627	TTA	2	6	15510	15515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017627	TACT	2	8	15533	15540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017627	AAT	2	6	18508	18513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017627	GCTGAT	2	12	18598	18609	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017627	GGA	2	6	18636	18641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017627	CTC	2	6	18709	18714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017627	TGT	2	6	18767	18772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017627	A	6	6	18773	18778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017627	TCGCA	2	10	18825	18834	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017627	CT	3	6	18850	18855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017627	CAA	2	6	18886	18891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017627	GAA	2	6	18946	18951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017627	GAA	2	6	18958	18963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017627	CGT	2	6	19045	19050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017627	CTG	2	6	19072	19077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017627	TCG	2	6	19161	19166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017627	GAA	2	6	19213	19218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017627	AAC	2	6	19274	19279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017627	AGC	2	6	19291	19296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017627	CTGAA	2	10	20229	20238	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017627	TACG	2	8	21667	21674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017627	TCG	2	6	21719	21724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017627	G	6	6	21749	21754	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017627	TGG	2	6	21787	21792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017627	GTC	2	6	21804	21809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017627	CGT	3	9	21819	21827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017627	GGT	2	6	21971	21976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017627	TC	3	6	22008	22013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017627	GGCT	2	8	22131	22138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017627	GCA	2	6	22152	22157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017627	TAT	2	6	22245	22250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017627	GCA	2	6	22289	22294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017627	GCG	2	6	22325	22330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017627	CAA	2	6	22374	22379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017627	ATA	2	6	22456	22461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017627	TAT	2	6	22522	22527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017627	GTTT	2	8	22540	22547	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017627	CCT	2	6	23004	23009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017627	CAG	2	6	25551	25556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017627	CA	3	6	25590	25595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017627	ATT	2	6	25599	25604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017627	A	6	6	25623	25628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017627	ATT	2	6	25640	25645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017627	TAC	2	6	25673	25678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017627	CCA	2	6	25681	25686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_017627	CAC	2	6	25695	25700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_017627	CCA	2	6	25723	25728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_017627	TCA	2	6	25816	25821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_017627	TCC	2	6	25909	25914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_017627	G	7	7	25933	25939	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_017627	TA	3	6	26657	26662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017627	TAT	2	6	26688	26693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_017627	ATCA	2	8	42603	42610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
290	NC_017627	A	6	6	42612	42617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_017627	TA	3	6	43062	43067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017627	AATA	2	8	43082	43089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_017627	GGC	2	6	96225	96230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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